MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_4

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011093	TCGC	2	8	11	18	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011093	ACC	2	6	50	55	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011093	CCG	2	6	102	107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011093	GCT	2	6	116	121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011093	CGC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733901
6	NC_011093	CATA	2	8	247	254	50 %	25 %	0 %	25 %	194733901
7	NC_011093	CT	3	6	312	317	0 %	50 %	0 %	50 %	194733901
8	NC_011093	CA	3	6	747	752	50 %	0 %	0 %	50 %	194733901
9	NC_011093	CCAG	2	8	942	949	25 %	0 %	25 %	50 %	194733901
10	NC_011093	CTG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733901
11	NC_011093	AGC	2	6	989	994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733901
12	NC_011093	ATC	2	6	1033	1038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733901
13	NC_011093	CGG	2	6	1052	1057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733901
14	NC_011093	TTC	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733901
15	NC_011093	GCG	2	6	1085	1090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733901
16	NC_011093	TTCC	2	8	1105	1112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011093	CGAC	2	8	1120	1127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011093	GTTT	2	8	1182	1189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011093	TGT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011093	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011093	GTA	2	6	1553	1558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011093	T	8	8	1567	1574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011093	ATT	2	6	1619	1624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733898
24	NC_011093	ACC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733898
25	NC_011093	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733898
26	NC_011093	A	7	7	1750	1756	100 %	0 %	0 %	0 %	194733898
27	NC_011093	AAG	2	6	1798	1803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733898
28	NC_011093	ACA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733898
29	NC_011093	AATA	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	194733898
30	NC_011093	AAT	2	6	1966	1971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011093	AT	3	6	2044	2049	50 %	50 %	0 %	0 %	194733900
32	NC_011093	AGA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733900
33	NC_011093	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733900
34	NC_011093	GA	3	6	2131	2136	50 %	0 %	50 %	0 %	194733900
35	NC_011093	AGC	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733900
36	NC_011093	AAC	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733900
37	NC_011093	GTTT	2	8	2275	2282	0 %	75 %	25 %	0 %	194733900
38	NC_011093	ATA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733900
39	NC_011093	ATTTA	2	10	2305	2314	40 %	60 %	0 %	0 %	194733900
40	NC_011093	CAAT	2	8	2325	2332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011093	ACA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011093	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733899
43	NC_011093	TTG	2	6	2482	2487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733899
44	NC_011093	CTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733899
45	NC_011093	GCG	2	6	2714	2719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733899
46	NC_011093	ATTC	2	8	2766	2773	25 %	50 %	0 %	25 %	194733899
47	NC_011093	T	6	6	2802	2807	0 %	100 %	0 %	0 %	194733899
48	NC_011093	C	6	6	2844	2849	0 %	0 %	0 %	100 %	194733899
49	NC_011093	GTT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733899
50	NC_011093	ACA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733899
51	NC_011093	AT	3	6	2962	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	194733899
52	NC_011093	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	194733899
53	NC_011093	AGC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733899
54	NC_011093	T	6	6	3150	3155	0 %	100 %	0 %	0 %	194733899
55	NC_011093	TGC	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733899
56	NC_011093	CGC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733899
57	NC_011093	GGC	2	6	3268	3273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733899
58	NC_011093	GAT	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733899
59	NC_011093	CG	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	194733899
60	NC_011093	CAA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733899
61	NC_011093	GGC	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733899
62	NC_011093	CGG	2	6	3432	3437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733899
63	NC_011093	T	6	6	3455	3460	0 %	100 %	0 %	0 %	194733899
64	NC_011093	A	6	6	3499	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	194733899
65	NC_011093	TGC	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733899
66	NC_011093	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733899
67	NC_011093	CAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733899
68	NC_011093	GTT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733899
69	NC_011093	T	6	6	3731	3736	0 %	100 %	0 %	0 %	194733899
70	NC_011093	TTC	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733899
71	NC_011093	ATG	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733899
72	NC_011093	TCC	2	6	3824	3829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733899
73	NC_011093	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011093	ACT	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011093	GAT	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733897
76	NC_011093	GCAG	2	8	4038	4045	25 %	0 %	50 %	25 %	194733897
77	NC_011093	AAC	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733897
78	NC_011093	AGC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733897
79	NC_011093	A	8	8	4204	4211	100 %	0 %	0 %	0 %	194733897
80	NC_011093	AAC	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733897
81	NC_011093	A	6	6	4229	4234	100 %	0 %	0 %	0 %	194733897
82	NC_011093	A	6	6	4259	4264	100 %	0 %	0 %	0 %	194733897
83	NC_011093	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733897
84	NC_011093	GCA	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733897
85	NC_011093	TGG	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733897
86	NC_011093	TGC	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733897

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.